clinic.RdThis data
clinic
one instance, 1 row per patient
IGR, Villejuif, France
#> ID CGH CGH_barcode GE GE_barcode CGH.GE CGH_only GE_only sexe age_j #> 484N P01 1 26606_1_1 1 12313_1_2 1 0 0 F NA #> 541N P02 1 26622_1_1 1 12313_1_3 1 0 0 F NA #> ADOM P03 1 28068_1_1 1 11955_1_1 1 0 0 F 2885 #> BAUK P04 1 14175_1_3 1 27014_1_4 1 0 0 M NA #> BERG P05 1 14175_1_4 1 27014_1_3 1 0 0 M NA #> BIOS P06 1 26347_1_1 1 11956_1_2 1 0 0 F 5 #> age_mois age_an OMS_2 localisation grade.OMS Glial OMS_Malin #> 484N <NA> 8 5 hemispheres 3 1 1 #> 541N <NA> 14 1 hemispheres 3 1 1 #> ADOM 96,1666666667 8,0138888889 3 DIPG 3 1 1 #> BAUK <NA> 6,2 NA DIPG 4 1 1 #> BERG <NA> 4,7 NA DIPG 2 1 0 #> BIOS 0,1666666667 0,0138888889 2 hemispheres 4 1 1 #> OMS_Malin_Glial Gliome_Tronc OMS_Malin_Glial_CGH OMS_Malin_Glial_GE #> 484N 1 0 1 1 #> 541N 1 0 1 1 #> ADOM 1 1 1 1 #> BAUK 1 1 NA NA #> BERG 0 1 NA NA #> BIOS 1 0 1 1 #> OMS_Malin_Glial_CGH.GE Sainte_Anne Sainte_Anne_Malin #> 484N 1 NA 1 #> 541N 1 NA 1 #> ADOM 1 3 1 #> BAUK NA NA NA #> BERG NA NA NA #> BIOS 1 8 1 #> Sainte_Anne_Sousclasse_Malin Sainte_Anne_Sousclasse_Malin_Fullname DNA RNA #> 484N <NA> <NA> 1 1 #> 541N <NA> <NA> 1 1 #> ADOM A Astro 1 1 #> BAUK Glioneuro NA NA #> BERG Oligo NA NA #> BIOS G Glioneuro 1 1 #> ddn dcd_O1N0 dddiag dddn FUtotal_j #> 484N <NA> 1 <NA> <NA> 789 #> 541N <NA> 1 <NA> <NA> 587 #> ADOM 17/01/97 1 12/11/04 01/01/07 751 #> BAUK 14/11/01 1 16/01/08 09/08/08 252 #> BERG 30/05/03 1 21/01/08 16/09/08 260 #> BIOS 24/01/06 0 29/01/06 10/02/09 1108 #> HTIC_hypertension_intracranienne def_moteur cerebelleux epilepsie fortuite #> 484N NA NA NA NA NA #> 541N NA NA NA NA NA #> ADOM 1 1 0 0 0 #> BAUK NA NA NA NA NA #> BERG NA NA NA NA NA #> BIOS 1 0 0 1 0 #> nerfs_craniens ddeb localisation.1 Tas_TC Tas_ST tas_thal_ped Tas_NGC #> 484N NA <NA> NA NA NA NA NA #> 541N NA <NA> NA NA NA NA NA #> ADOM 1 11/01/04 2 0 NA NA NA #> BAUK NA 31/12/07 2 NA NA NA NA #> BERG NA 20/12/07 2 NA NA NA NA #> BIOS 0 29/01/06 0 NA 0 NA NA #> synd_masse Taille architecture polycyclique type_pc gado gadoinfT2 cyst #> 484N NA NA NA NA NA NA NA NA #> 541N NA NA NA NA NA NA NA NA #> ADOM 1 2 1 0 4 1 1 0 #> BAUK NA NA NA NA NA NA NA NA #> BERG NA NA NA NA NA NA NA NA #> BIOS 1 2 1 1 2 1 0 1 #> necrose limites oedème calclfication attache_meningee attache_med #> 484N NA NA NA NA NA NA #> 541N NA NA NA NA NA NA #> ADOM 0 0 NA NA NA NA #> BAUK NA NA NA NA NA NA #> BERG NA NA NA NA NA NA #> BIOS 1 1 1 NA 1 1 #> attache_epend ddchir exerese res_radi radioth chimio nbrerechutes #> 484N NA <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> NA #> 541N NA <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> NA #> ADOM NA 15/12/04 biopsie st oui oui oui 2 #> BAUK NA 16/01/08 NA #> BERG NA 23/01/08 NA #> BIOS 1 22/06/06 totale non <NA> oui 0 #> Fraction_Gain Fraction_Loss Fraction_Aberrant Hclust_4branches #> 484N 0,130560928 0,3224373506 0,4529982787 X #> 541N 0,098218033 0,0906527773 0,1888708102 Y #> ADOM 0,0650907191 0,1523677704 0,2174584895 Y #> BAUK <NA> <NA> <NA> #> BERG <NA> <NA> <NA> #> BIOS 0,0039212192 0,0019214915 0,0058427107 Z2 #> Hclust_3branches predictions_groupe_CGH group_Kmeans group_CGH_DIPG #> 484N X X #> 541N X X #> ADOM Y Y km1 A #> BAUK km1 A #> BERG km1 A #> BIOS Z Z